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本文为了探究其潜在的分子机制，作者运用RNA测序（RNA-seq）和iTRAQ标记定量蛋白组学，对不同成熟度水平的油脂种子进行了研究。不仅揭示了关键候选基因和蛋白质的时间特异性表达，而且为该树种的遗传改良提供了科学依据。中文标题：基于iTRAQ蛋白质组学和转录组学联合分析揭示油茶种子成熟过程中油质相关的关键代谢产物的积累研究对象：油茶种子发表期刊：HorticultureResearch影响因子：6.793发表时间：2021.07.01发表单位：海南大学园艺园林学院运用生物技术：RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学、转录组学、蛋白组学文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持蛋白质组学,修饰蛋白质组,蛋白·修饰·代谢。北京蛋白组学测试多少钱

转录组学和蛋白质组学分析作者通过转录组学和蛋白质组学分析暴露于DON的C2C12细胞的差异基因（DEG）。转录组学鉴定了2387个DEG，其中72%被下调。蛋白质组学鉴定出402个DEG，其中74%被下调。GO和KEGG通路富集分析表明，转录组学DEGs参与了“男性主要性征的发育”、“骨骼肌肌球蛋白粗丝组装”和“骨骼肌收缩的调节”等生物学过程。**富集的通路是“ECM-受体相互作用”、“人**瘤病毒***”和“蛋白质消化吸收”。蛋白质组学分析中，富集到了“肌肉收缩”、“中间丝解聚”和“脂质转运”等生物学过程。细胞成分中富集到“细胞骨架”、“细胞外基质”和“整合素”。KEGG通路富集到“新霉素、卡那霉素和庆大霉素生物合成”、“系统性红斑狼疮”、“ECM-受体相互作用”和“蛋白质消化和吸收”。前两条通路与上调的DEG相关，而后两条通路与下调的DEG相关，这与转录组学结果一致。北京蛋白组学测试多少钱欧易鹿明生物基于质谱技术,生物信息学方法,提供蛋白质组学。

为了验证iTRAQ标记蛋白组学分析测定的蛋白积累变化，选择两种蛋白进行westernblot分析。如图4A所示，iTRAQ分析中两种蛋白(RPD3和VMA3)的积累每次均与westernblot数据一致。RPD3、TOR1、VMA3和VAC8在基因水平上的相对表达量与蛋白水平相似，在BF的菌丝中也表达上调(图4B-D)。VAC8在2－1、3－1、4－1组的基因水平上高度上调。这些结果表明，这些上调的表达蛋白可能是香菇BF形成的重要蛋白。本研究利用标记定量(iTRAQ)蛋白质组学、基于气相色谱-质谱的代谢组学GC-MS非靶向代谢组学和透射电镜分析细胞结构，研究了香菇菌丝后熟转色形成的机制，并且***证明氧化应激和自噬过程是至关重要，为后续进一步的研究提供了新的见解。

蛋白质是生命活动的主要执行者，而蛋白质磷酸化修饰是生物体内**重要的共价修饰方式之一，真核生物体内有超过三分之一的蛋白可以发生磷酸化修饰。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及**发生等过程在内的所有生命活动。单一的磷酸化蛋白质组学只能解释蛋白磷酸化水平发生的变化，而[黄金搭档]——蛋白质组与磷酸化蛋白质组联合分析，则在揭示疾病相关特性、筛选疾病生物标志物、寻找药物靶点等方面发挥了更加重要的作用。蛋白验证新技术-PRM,平行反应监视蛋白组学。

TMT标记定量蛋白质组学研究案例：2021年12月威尔康奈尔医学中心和纪念斯隆凯特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授课题组在Nature Communications期刊发表的题为 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果，通过蛋白质组学和代谢组学研究方法，发现了高度转移性 SOX2/OCT4+ 细胞的离散亚群表现出细胞内铜水平升高特征，探究了TM 介导的复合物 IV 失活确定为 SOX2/OCT4+ 细胞群中的主要代谢缺陷，AMPK/mTORC1 能量传感器为重要的下游途径。描绘了铜-代谢-转移轴，为高风险三阴性乳腺*患者的下一代治疗方法提供了理论依据。中文标题：铜耗竭调节线粒体氧化磷酸化以损害三阴性乳腺*转移研究对象：高风险三阴性乳腺*(TNBC)发表期刊：NatureCommunications影响因子：14.919发表时间：2021年12月合作单位：纪念斯隆凯特琳**中心，Sandra和EdwardMeyer**中心运用关键生物技术：TMT标记定量蛋白质组学和靶向代谢组学蛋白组学研究组织,血液,植物,尿液,动物,细胞样品,酵母,微生物.。浙江蛋白组学的ipa分析

蛋白质组学多组学分析蛋白质组学研究进展。北京蛋白组学测试多少钱

本文为中国科学院海岸带研究所赵建民课题组在ScienceoftheTotalEnvironment期刊发表了的文章，通过iTRAQ标记定量蛋白质组学研究弧菌***加剧了海洋酸化造成的牡蛎免疫抑制效应。海洋酸化可能增加海洋软体动物疾病加剧的风险。从而将产生重大的经济和生态影响，因此本研究结果具有重要的指导意义。在本研究中，研究者将太平洋牡蛎暴露于酸化海水（约2000ppm）中28天，然后用金氏弧菌进行***处理，以此研究海洋酸化是否会影响牡蛎对病原菌***的免疫反应。此外，利用基于iTRAQ的定量蛋白质组学方法，对牡蛎鳃这一潜在的造血部位进行了研究，以分析对OA和金氏弧菌共同作用较敏感的生理过程。北京蛋白组学测试多少钱

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